如何进行单基因的tcga数据挖掘分析,针对这个问题,这篇文章详细介绍了相对应的分析和解答,希望可以帮助更多想解决这个问题的小伙伴找到更简单易行的方法。
TCGA数据库关于食管癌的,分成ESCC和EAC,其中ESCC好发于中国人群,关心TCGA数据库里面的90个ESCC病人。
根据CCL2基因的表达量,可以把TCGA数据库里面的90个ESCC病人分成高低表达CCL2的两个组,然后可以差异分析,GSEA分析等等
这次的学徒作业是完成下面的4幅图:
如下图:
其中图f可以直接网页工具做出来,UCSC的xena浏览器,或者GEPIA2都可以,需求最大的是tcga数据库的生存分析和表达量差异。
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