温馨提示×

温馨提示×

您好,登录后才能下订单哦!

密码登录×
登录注册×
其他方式登录
点击 登录注册 即表示同意《亿速云用户服务条款》

R语言的参数check.names有什么用

发布时间:2022-03-05 15:12:13 来源:亿速云 阅读:2685 作者:iii 栏目:开发技术

本篇内容介绍了“R语言的参数check.names有什么用”的有关知识,在实际案例的操作过程中,不少人都会遇到这样的困境,接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧!希望大家仔细阅读,能够学有所成!

R语言在读取数据 例如read.table 添加check.names=F 参数可以保证数据种特殊的字符正常读取:

如数据表头 “-”被认为是“." 

> A=read.table("F:/test/WGCNA/data/fpkm/All.DEG_final_3000.xls",sep="\t",check.names=T,header=T)
> head(A,2)
         ID CK.WT.1 CK.WT.2 CK.WT.3 CK.tdr1.1 CK.tdr1.2 CK.tdr1.3  NaWT.1  NaWT.2  NaWT.3
1 AT1G01010 3.74149  7.3618 5.81734   5.71131   7.97054  10.37620 6.29949 5.55062 5.84779
2 AT1G01030 5.23528  2.7707 2.66859   3.22632   1.32105   1.96726 2.40259 3.23077 4.80378
  Natdr1.1 Natdr1.2 Natdr1.3 Na.WT.1 Na.WT.2  Na.WT.3 Na.tdr1.1 Na.tdr1.2 Na.tdr1.3
1 15.58810 14.76360 17.74670 9.84943 7.97949 6.841060  13.29120  25.37000  19.59940
2  2.04301  2.29524  1.95286 1.83377 1.70757 0.809564   3.23172   1.80478   2.06044
    SWT.1   SWT.2   SWT.3 Stdr1.1 Stdr1.2  Stdr1.3
1 4.96687 5.53349 3.18816 6.93650 7.88402 11.25040
2 8.49256 2.65564 2.25570 4.35298 4.52147  7.11351
> A=read.table("F:/test/WGCNA/data/fpkm/All.DEG_final_3000.xls",sep="\t",check.names=F,header=T)
> head(A,2)
         ID CK-WT-1 CK-WT-2 CK-WT-3 CK-tdr1-1 CK-tdr1-2 CK-tdr1-3  NaWT-1  NaWT-2  NaWT-3
1 AT1G01010 3.74149  7.3618 5.81734   5.71131   7.97054  10.37620 6.29949 5.55062 5.84779
2 AT1G01030 5.23528  2.7707 2.66859   3.22632   1.32105   1.96726 2.40259 3.23077 4.80378
  Natdr1-1 Natdr1-2 Natdr1-3 Na-WT-1 Na-WT-2  Na-WT-3 Na-tdr1-1 Na-tdr1-2 Na-tdr1-3
1 15.58810 14.76360 17.74670 9.84943 7.97949 6.841060  13.29120  25.37000  19.59940
2  2.04301  2.29524  1.95286 1.83377 1.70757 0.809564   3.23172   1.80478   2.06044
    SWT-1   SWT-2   SWT-3 Stdr1-1 Stdr1-2  Stdr1-3
1 4.96687 5.53349 3.18816 6.93650 7.88402 11.25040
2 8.49256 2.65564 2.25570 4.35298 4.52147  7.11351

data.frame() 函数在进行数据框组合时也存在 字符变化,需要设置check.names=F

数据框:

> A1=A[,1:12]
> head(A1,2)
         ID CK-WT-1 CK-WT-2 CK-WT-3 CK-tdr1-1 CK-tdr1-2 CK-tdr1-3  NaWT-1  NaWT-2  NaWT-3
1 AT1G01010 3.74149  7.3618 5.81734   5.71131   7.97054  10.37620 6.29949 5.55062 5.84779
2 AT1G01030 5.23528  2.7707 2.66859   3.22632   1.32105   1.96726 2.40259 3.23077 4.80378
  Natdr1-1 Natdr1-2
1 15.58810 14.76360
2  2.04301  2.29524
> A2=A[,13:24]
> head(A2,2)
  Natdr1-3 Na-WT-1 Na-WT-2  Na-WT-3 Na-tdr1-1 Na-tdr1-2 Na-tdr1-3   SWT-1   SWT-2   SWT-3
1 17.74670 9.84943 7.97949 6.841060  13.29120  25.37000  19.59940 4.96687 5.53349 3.18816
2  1.95286 1.83377 1.70757 0.809564   3.23172   1.80478   2.06044 8.49256 2.65564 2.25570
  Stdr1-1 Stdr1-2
1 6.93650 7.88402
2 4.35298 4.52147

组合:

> B=data.frame(A1,A2)
> head(B,2)
         ID CK.WT.1 CK.WT.2 CK.WT.3 CK.tdr1.1 CK.tdr1.2 CK.tdr1.3  NaWT.1  NaWT.2  NaWT.3
1 AT1G01010 3.74149  7.3618 5.81734   5.71131   7.97054  10.37620 6.29949 5.55062 5.84779
2 AT1G01030 5.23528  2.7707 2.66859   3.22632   1.32105   1.96726 2.40259 3.23077 4.80378
  Natdr1.1 Natdr1.2 Natdr1.3 Na.WT.1 Na.WT.2  Na.WT.3 Na.tdr1.1 Na.tdr1.2 Na.tdr1.3
1 15.58810 14.76360 17.74670 9.84943 7.97949 6.841060  13.29120  25.37000  19.59940
2  2.04301  2.29524  1.95286 1.83377 1.70757 0.809564   3.23172   1.80478   2.06044
    SWT.1   SWT.2   SWT.3 Stdr1.1 Stdr1.2
1 4.96687 5.53349 3.18816 6.93650 7.88402
2 8.49256 2.65564 2.25570 4.35298 4.52147
> B=data.frame(A1,A2,check.names=F)
> head(B,2)
         ID CK-WT-1 CK-WT-2 CK-WT-3 CK-tdr1-1 CK-tdr1-2 CK-tdr1-3  NaWT-1  NaWT-2  NaWT-3
1 AT1G01010 3.74149  7.3618 5.81734   5.71131   7.97054  10.37620 6.29949 5.55062 5.84779
2 AT1G01030 5.23528  2.7707 2.66859   3.22632   1.32105   1.96726 2.40259 3.23077 4.80378
  Natdr1-1 Natdr1-2 Natdr1-3 Na-WT-1 Na-WT-2  Na-WT-3 Na-tdr1-1 Na-tdr1-2 Na-tdr1-3
1 15.58810 14.76360 17.74670 9.84943 7.97949 6.841060  13.29120  25.37000  19.59940
2  2.04301  2.29524  1.95286 1.83377 1.70757 0.809564   3.23172   1.80478   2.06044
    SWT-1   SWT-2   SWT-3 Stdr1-1 Stdr1-2
1 4.96687 5.53349 3.18816 6.93650 7.88402
2 8.49256 2.65564 2.25570 4.35298 4.52147

“R语言的参数check.names有什么用”的内容就介绍到这里了,感谢大家的阅读。如果想了解更多行业相关的知识可以关注亿速云网站,小编将为大家输出更多高质量的实用文章!

向AI问一下细节

免责声明:本站发布的内容(图片、视频和文字)以原创、转载和分享为主,文章观点不代表本网站立场,如果涉及侵权请联系站长邮箱:is@yisu.com进行举报,并提供相关证据,一经查实,将立刻删除涉嫌侵权内容。

AI